Erre azért kell különösen figyelni, mert kapcsolt vállalkozásokra vonatkozóan a társasági adótörvény (1996. évi LXXXI. törvény) több esetben is az általánostól eltérően rendelkezik. Ezek közül talán a legjelentősebb a szokásos piaci ár alkalmazására, és – a körülményektől függően – transzferár nyilvántartás elkészítésére, valamint adatszolgáltatás teljesítésére vonatkozó kötelezettség.

Speciális szabályokat kell figyelembe venni a kapcsolt vállalkozásoknak többek között akkor is, ha ingyenesen adnak át pénzeszközt vagy bármely más eszközt egymás között, vagy követelést engednek el. Persze nem csak hátránya van a kapcsolt státusznak, ugyanis vannak olyan kedvezmények, amelyek kapcsolt felek között megoszthatók (pl. a műemléki ingatlanra vonatkozó beruházás kedvezménye), valamint társasági adócsoport alapítása is csak kapcsolt felek között lehetséges.